Kejaksaan Negeri Batu memiliki 5 Seksi yakni Seksi Intelijen, Seksi Tindak Pidana Khusus, Seksi Tindak Pidana Umum, Seksi Perdata dan TUN dan Seksi Pengelolaan Barang Bukti dan Barang Rampasan. Dibawahnya, juga memiliki Subbagian Pembinaan dari masing-masing Seksi.
